具体实例的分析方法的中文版能再发一个文章么?
具体实例的分析方法的中文版能再发一个文章么?
@byemax 因为我也有在一些文献的方法中,发现作者除了做LRT检验,还做了FDR correction多重检验,所以想请教下,是否做一个检验就够了。谢谢回复😁
选择压力分析,从序列下载到结果绘图选择压力及基因在进化过程中所受到的压力,也称自然选择。 在遗传学中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率(Ks)之间的比例。 一般认为,同义...
@byemax 请问,需要做FDR correction 吗
选择压力分析,从序列下载到结果绘图选择压力及基因在进化过程中所受到的压力,也称自然选择。 在遗传学中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率(Ks)之间的比例。 一般认为,同义...
@Mr_我爱读文献 好的,太感谢了。
学会正确选择多序列比对(coding-sequences)软件前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析,没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
非常感谢您的分享。我的问题是:您既然通过MACSE得到了比对好的codon序列,为什么不直接进行修建然后去做paml分析;而是先将其转为氨基酸然后修建后再将其转为核苷酸序列再比对再修建呢?(不好意思,不知道是否对您的流程图理解正确否)。
学会正确选择多序列比对(coding-sequences)软件前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析,没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
@Morriyaty 谢谢回复。理解了
比较基因组从入门到放弃(2)树的构建 基因树 并联树 串联树 mcmctree建议使用氨基酸序列做
👍👍👍
请问使用EasySpeciesTree脚本进行物种系统发育树的构建,发表文章时该如何引用
不好意思,我想请问下为什么需要修改枝长,重新定根呢,phybase是什么意思呀
比较基因组从入门到放弃(2)树的构建 基因树 并联树 串联树 mcmctree建议使用氨基酸序列做