IP属地：北京
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R语言绘制组间比较散点图并自动添加P值信息
查询ggprism包使用时候发现官网给出的一示例图比较常用，这里记录学习一下。 加载R包准备数据 注意两个细节： tools::toTitleC...
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利用abbrevr包批量输出期刊缩写有时候用endnote导入文献后显示的是期刊全称，而用到缩写时候就需要去一些网站上一个个搜索，比如CASSI[https://cassi.cas...
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利用massdatabase包提取物种KEGG通路与基因/化合物对应信息
最近手头处理一批代谢组数据, 想基于几十个关键差异代谢物代谢物进行下KEGG富集，能想到有两种方式解决，一种常用方式就是基于MetaboAnal...
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基于GO-Figure快速绘制GO富集气泡图
GO-Figure! 是一个基于pyhton写的GO富集小软件，方便我们拿到富集结果后直接使用命令行的形式进行可视化，绘制出具有灵活性、可重复性...
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一个轻量级绘制热图的R包-HeatmapR
目前R中绘制热图的方式有很多，常用的如pheatmap、ComplexHeatmap包等，这里再给大家介绍一个轻量级的R包-HeatmapR包，...
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分级KEGG富集pathway图绘制最近在基迪奥平台上看到了这张KEGG富集信息图，刚好手头有批现成的转录组数据，刚好绘制一下给富集图换换风格~~image.png 准备输入文件 ...
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学会这三个包，搞定R中的正则天下苦正则久矣，尤其当字符串中有自己想要的一段数据时候苦苦提取不出来的感觉真是难受，今天给大家介绍3个R包来解决这种正则带来烦恼的包，希望对大家...
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SFINX: 一个基于Shiny部署的鉴定蛋白互作关系平台
目前研究蛋白质互作方法有很多，传统的方法是将天然蛋白免疫沉淀与质谱检测结合(CoIP-MS)，另外流行的还有亲和纯化/质谱法(AP-MS)，与C...
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Robust火山图：一种含离群值的代谢组数据差异分析方法
代谢组学中差异代谢物的识别仍然是一个巨大的挑战，并在代谢组学数据分析中发挥着突出的作用。由于分析、实验和生物的模糊性，代谢组学数据集经常包含异常...