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# 大数据的统计学基础
概率论与统计学 概率论是统计学的基础，统计学冲锋在应用第一线，概率论提供武器。 我们在学习R的时候，会做过假设检验。做假设检验的时候会有一个基本...
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突然间，我感觉我喜欢上了for，真心好用！今天健明大大的群里发布了一个小作业：数据框中的某一列存在NA，目的是想用数据框的每一列的平均数替换每一列的NA值。今天周六，下午给老板交代完任务...
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植物重测序---变异检测（samtools+bcftools篇）
植物基因组重测序除了GATK的方法进行变异检测以外，还有samtools+bcftools去进行变异检测。在这里我们不去分析哪一种分析方法好，使...
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scRNAseq上游分析
最近对单细胞转录组很感兴趣，就跑了一跑~以下就是单细胞转录组的上游分析过程。如有不对，请大家多多指点。 1.cellranger-3.1.0下载...
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SnpEff结果解读SnpEff结果文件的解读 根据上一篇简书中SnpEff结果产生的4个文件进行解读 第一个文件：positive.snp.eff.vcf 其实p...
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SnpEff使用方法
SnpEff使用方法 SnpEff 软件通过基因组结构注释数据（GTF文件），对VCF文件中的SNP/InDel信息进行注释，即主要解释了SNP...
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水稻RNA-seq数据分析（上游）
水稻（学名：Oryza sativa）是草本稻属的一种，也是稻属中作为粮食的最主要最悠久的一种，又称为亚洲型栽培稻，简单来说也可以说是稻。全世界...
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2019/9/30 武大读博一个月
开学一个月，简书解封了！ 博士开学一个月，生活和科研的环境已经完全适应。 开学一个月，每天游走于水稻国重和湖滨宿舍，沿途路过樱园，每晚伴着东湖入...
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2019-07-31如何获取转录本ID和基因ID的对应关系--生信技能树第一个任务：任意物种拿到转录本ID 与基因ID的对应关系列表 从ensemble数据库中下载了Human的基因组注释文件gtf文件 1.下载Hu...