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【转】单倍型基因组组装方法1. 什么是单倍型？ 同源染色体：同源染色体，一个来自母本，一个来自于父本。 单倍型：单倍体基因型的简称。遗传学上指在单条染色体上一系列遗传变异位点的组合。 2. 单倍型组装...
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基于3D-DNA，ALLHiC挂载二倍体基因组关于3D-DNA，前面已经有简单介绍，本次主要介绍ALLHiC分析流程 ALLHiC的流程主要分为以下5个步骤： Prune: 修剪（二倍体基因组可以不用） Partitio...
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可以大佬回复啦也踢我一下
用Hifiasm基于HiFi数据组装基因组：（一）简介Hifiasm软件和HiFi数据
(全文约900字) 1. HiFi数据 HiFi reads（High Fidelity reads）是2019年由PacBio公司推出的基于环化一致性序列（Circular...
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使用EDTA评估基因组LAI值EDTA的功能设计是用来de novo注释全基因组的TE序列 安装EDTA EDTA github[https://github.com/oushujun/EDTA] ED...
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生信 | 基因组组装实战（二）：Survey数据质控、NT比对写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1. Survey分析的目的 ...
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生信 | 基因组组装实战（一）：基础知识与基本思路写在前面 以下内容均来自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班课堂笔记 1. Genome de nove 基础知...
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如何使用Juicebox 对juicer和3dDNA运行后的HiC结果进行可视化编辑推荐首先研读官方github教程 Juicebox Assembly Tools[https://github.com/aidenlab/Juicebox/wiki/Juic...
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平凡的生信之路<br>HUBU<br>UCAS<br>NUS<br>PKU
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2024-07-25 liunx系统技术历史命令
建立一个.inputrc文件夹 # /etc/inputrc - global inputrc for libreadline # See readline(3readlin...
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2021-05-20 ###520###之亲爱的在哪里？
神奇动物在哪里？（linux命令中which、whereis、locate有什么区别？） 1.find find是最常用和最强大的查找命令。它能做到实时查找，精确查找，但速度...
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2024-02-23 基因组组装
利用Canu进行组装 canu -p YueC -d canu genomeSize=3g useGrid=false maxThreads=24 -pacbio-hifi ...
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