前情提要 ggplot2不能截断纵坐标肿么办讲了几种截断方法，各有长短，我在这篇文章发出去后收到两个反馈，特来与大家分享 新方法1.拼图 出处：https://huifan...
IP属地：陕西
-
ggplot2截断纵坐标--后续 -
试图厘清热图相关的一些细节森严森语： 生活中很多时候我都习惯于不知所以而为之，其结果通常坏。原因在于经常的盲目自信和偶尔不愿承认自己的无知。 上篇推文介绍了利用Origin绘制热图的方法，推文一经发出...
-
Meta小课题：K-mer什么是K-mer? mer : 分子生物学领域中意义为：monomeric unit ( mer) ：单体单元，相当于nt或者bp。通常用于双链核酸中的单位，100 mer ...
-
使用mixcr构建免疫组库及下游分析免疫组库（Immune Repertoire，IR）是指个体在某个特定时间其循环系统中所有多样性的T细胞和B细胞的总和，即V(D)J序列多样性的集合。免疫组库分析是指运用高通...
-
【文献】T细胞受体库分析方法综述-2018-12-03背景 T细胞介导的抗原识别主要是依靠T细胞受体（TCR）和主要组织相容性复合体MHC的相互作用。如下图a：TCR是一群具有高度多样性的二聚体，由α链和β链构成，或者由γ链和δ...
-
复旦研究僧，一个从计算机坑跳进医学数据挖掘的小白
-
Permutation test（置换检验）以及在R中的应用Permutation test 可以称作是置换检验，Fisher于20世纪30年代提出的一种基于大量计算（computationally intensive），利用样本数据...
-
不愿闭门造车<br>欢迎批评指正
-
2019-08-09 一张图串联基本的统计学自从入了生信的坑，就无时不刻不被导师吐槽统计学知识和思想的匮乏。思想一时半会是够呛建立了，先把知识学一下吧。搜集各方资料，出图一张！ 另外，特别喜欢这个博主的生物统计专题：分...
-
使用R语言绘制热图：R包pheatmap的全参数详细介绍pheatmap参数： 网上有针对热图绘制的粗略讲解，但是都是参数不完整，可能不能满足所有人需求，于是手动整理了热图的全参数介绍。 mat 数组矩阵（要绘制热图的数据源，保证...
-
一起学生信。
-
R语言基础7--R语言中的正则表达式R语言基础系列： R语言基础1--R数据格式：.rds和.rda的区别[https://www.jianshu.com/p/6a824548887b] R语言基础2--数据排...
-
2019-12-05（关于logfc和p值）
9：00-9：40 昨天在小郭老师讲述了关于logfc和p值的含义，差不多有点理解的框架。差异倍数(fold change)，fold change翻译过来就是倍数变化。li...
-
独立开发者，终身学习者，喜欢交朋友，欢迎讨论，共同成长，一起进步。
-
单细胞研究联合T细胞受体分析2022年【最新进展】这篇文章是单细胞转录组（scRNAseq）和TCRseq联合分析的一个综述，介绍了目前关于这两种数据联合分析的最新进展(2022年)。 1. 介绍 1.1 T细胞受体的作用 ...
-
个人wx公众号：木舟笔记。
-
个人主页：hbox.cool
-
使用immunarch包进行单细胞免疫组库数据分析（五）：Repertoire overlap and public clonotypes免疫组库重叠分析 免疫组库重叠（Repertoire overlap）是度量不同样本之间TCR或BCR库相似性的最常用方法。它是通过计算在给定的Repertoire之间共享的...
-
R语言画实现t-SNE分析和画图1.编一个数据 需要一个行为样本，列为变量(例如基因)的矩阵。 2.完成tsne分析并画图 画图搞起 3.神奇参数perplexity perplexity的默认值是30。样...
-
R语言可视化（十六）：PCA图绘制16. PCA图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 加载示例数据 使用prcomp函数进行PCA分析 使用基础plot函数绘制PCA图 使用ggplot2包绘制PCA图...
