dab0d5db93de - 简书

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dab0d5db93de

@xizzy 您好，感谢您的回答。我的研究目的是做普通转录组的上游分析，将人源的转录组数据从fastq格式原始数据处理到获得表达矩阵，应该较为适合使用parabricks。通过文章看到您的A30显卡显存为24 GB，分析人源转录组会不会出现显存不够的情况？我计划购买4060ti 16GB版用于数据处理，可以忍受速度慢一点，不知是否会因为显存不够而根本无法进行数据处理，您有什么建议么？🙏🙏🙏

GATK太慢？利用GPU加速让WGS/WES分析按分钟交付
目前，随着测序成本的降低，越来越多的WGS/WES项目开始普及，也更多的课题组拥有自己的服务器，但是大数据带来的计算缓慢问题也越发凸显。这里和大家分享基于英伟达GPU的 Cl...

xizzy
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xizzy
写了 15231 字，被 122 人关注，获得了 163 个喜欢

愿同你一起分享在生信分析和精品咖啡上的点滴！

dab0d5db93de

想问一下 Clara Parabricks需要付费么？

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目前，随着测序成本的降低，越来越多的WGS/WES项目开始普及，也更多的课题组拥有自己的服务器，但是大数据带来的计算缓慢问题也越发凸显。这里和大家分享基于英伟达GPU的 Cl...

xizzy
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六六_ryx
写了 90001 字，被 2423 人关注，获得了 1884 个喜欢

最近不常登陆简书，若评论问题没有及时回复，可以发邮件交流 bioinfortime@163.com
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生物信息
银色麦穗编，86 篇文章，912 人关注

高通量数据的处理，生物大数据分析，基因组，转录组，表观遗传。 linux，python，perl，R samtools，GATK，Plink，bedtools
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转录组入门（5）：序列比对
欢迎来GitHub上fork，一起进步： https://github.com/xuzhougeng 比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisa...

xuzhougeng
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生信杂谈
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分子模拟和基因组学大杂烩，我们是生物信息爱好者，开源，共享尽在生信杂谈~ 请关注微信公众号生信杂谈（xiaoddrz）获取更多原创精彩内容！<br>若您只是做基因的可以通过右侧文集筛选文章

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R语言批量爬取NCBI基因注释数据
网络爬虫（web crawler），也叫网络蜘蛛（spider），是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般为编纂网络索引。各大搜索引擎都可以被看做爬虫，根据爬取的内容...

生信杂谈
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黄树嘉
写了 89916 字，被 3089 人关注，获得了 1464 个喜欢
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生物信息学小站
BryceBryce 编，8 篇文章，44 人关注

分享必备技能，学习路线，资料，科研八卦
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……
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这个专题纪录我在学习生物信息学的过程中的一些收获
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rapunzel0103 编，19 篇文章，301 人关注

个人学习生信的一点心得欢迎讨论指摘
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quan575 编，343 篇文章，1512 人关注

生物信息学软件，perl、python、R、shell脚本交流分享
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生物信息学与算法
王诗翔编，1232 篇文章，4341 人关注

生信技能树：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公众号：优雅R 生物数据分析QA，技术文档与博客，需要你的参与。 ……………………………… 欢迎在简书创作和做笔记的生信学习者、爱好者以及相关编程人员加入本专题，贡献你的文字，无论是原创还是笔记，我们需要你，将本专题打造为生信知识宝库、交流平台。内容可以是对生物信息学与算法知识相关资源的收集、整理，以及原创笔记： * R * Python * Perl * Linux 工具与编程 * 绘图 * 统计 * 计算生物学 * 各类算法 * 机器学习

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社会热点
简书编，25491 篇文章，1510513 人关注

欢迎关注公众号简宝玉( 公众号ID : jianshu4321 )后台回复“指南”获取玩转简书绝密珍贵资料汇总；有问题，找宝玉。简宝玉同志会专程为你答疑解惑关于简书的一切。有思想、有深度、有分享、有见解的热点交流平台，在这里你能寻找到全球最快最新最热的热点文章，在这里，放飞你的激情，透过心灵，寻找另一个自己。专题主编：零露_清扬婉兮 http://www.jianshu.com/u/e22026e54f34 投稿须知：http://www.jianshu.com/p/675e55af0bf1
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奇思妙想
苏溪羽编，19212 篇文章，904481 人关注

欢迎来到不可能的世界。欢迎来到不可能的世界！在这里，你可以卸下伪装，成为你想成为的人。投稿前请仔细阅读【投稿指南】： https://www.jianshu.com/p/c7b1722dfc69 专题主编：苏溪羽 https://www.jianshu.com/u/4124159b2021 1.本专题收录各种类型的幻想故事、脑洞大开的文章，不怕离奇，只需逻辑自洽能够自圆其说即可。题材不限，但需包含“不可能”“非/超现实”“非真实”等奇思元素。 2.本专题不收连载、鸡汤文、观点文、诗歌等。 2.内容须为原创，不得抄袭。 3.字数要求：1500以上，一万字以下。 4.文章排版整洁，段落分明，无明显错别字；配图不可太密集、不能全篇黑体加粗、不能太多空行。 5.文章內不得有任何推广信息。包括但不限于公众号、微博、微信，更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。