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分训练集和测试集时:sam<- createDataPartition(meta$event, p = 0.05) 报错:Error in qu...
随机森林otu_forest <- randomForest(time ~ ., data = otu, importance = TRUE, ...
corralation 0.输入数据和R包 2.任意两个基因的相关性分析 2.1 简单绘图 使用ggpbur。 2.2 按照stage分组 不仅...
任意基因的任意分组比较 0.输入数据 这里面的数据: exp是tumor-normal都有的表达矩阵,exprSet是只有tumor样本的表达矩...
signafiture 0.R包 1.读取突变数据maf 是和上一篇一样的数据,从gdc下载的maf文件和临床信息 2.制作signatures...
maftools 变异数据处理的总体思路如下: 思维导图 1.数据下载 TCGA的突变数据有4个软件得到的不同版本: 这个可以在gdc的官网上找...
1.准备输入数据 2.挑选感兴趣的基因构建coxph模型 用survival::coxph()函数构建模型 3.模型可视化-森林图 4.模型预测...