将reads比对到参考序列 http://www.biotrainee.com/thread-766-1-1.htmlhttps://bedto...

质控 拼接 join_paired_ends.py -f 1_1.fq.gz -r 2_2.fq.gz -m fastq-join -o jo...

makeblastdb

安装

Prodigal（基因预测） RNAmmer (rRNA预测) 先安装hmmer-2.2g 下载http://www.cbs.dtu.dk/cg...

下载和安装https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/files/GapCloser/ 使用 需要...

https://github.com/OpenGene/fastp安装 使用 -i SS_G1.fastp.1.fq.tar.gz -I SS_...

手动安装MetaWRAP 依赖软件安装--apt安装 需要手动安装的软件 安装完后，添加maxbin和quast软件的路径到path安装Meta...