轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
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为什么要使用WSL 本地调试/测试服务器程序工作电脑是Win10系统,但目前大部分公司的服务器都是linux系统,某些要部署到服务器上的程序需要在本地进行测试时,因启动脚本都...
在做基因富集时,有些通路特别长,以至于使图片的大小不好控制,这种情况可以用stringr包的str_wrap来完成文本自动换行。如使用clusterProfiler的barp...
KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库),可以获得KEGG ORTHOLOGY(KO...
Differential gene expression analysis:差异表达基因分析 Differentially expressed gene (DEG):差异表达...
简要介绍利用eggNOG进行在线注释GO 其原理将query序列与eggNOG编号的蛋白进行多序列比对,确定保守位点,分析其进化关系。 每个eggNOG编号的蛋白为一类蛋白。...
导读 用query基因、DNA序列、16S扩增子序列、蛋白序列比对基因注释、物种注释 、基因功能注释数据库。Blast准确性高,速度慢。Diamond速度更快,常用于二代测序...
正常网址打不开?太慢?: https://github.com/PacificBiosciences/falcon/blob/HEAD/makefile[https://gi...
根据已有的蛋白库,对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对,从而获得相应的信息。 常用的数据库: Nr:NCBI官方非冗余蛋白数据库,包括PDB, Swiss-Prot, PIR...