1 原始数据下载及转换 从GEO下载原始数据需要使用官方工具SRA-tools,安装SRA-tools 1.1 原始数据下载 进入NCBI SRA数据库[https://tr...
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关键词 批次效应 批次校正 单细胞数据整合 适用背景 单细胞数据由于实验平台或样本等原因会造成不同数据集之间存在批次效应,这种批次效应是人为因素造成的,没有实际的生物学意义,...
年底复盘,发现很多知识点理解并不深入,想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响,我们需要对单细胞counts矩...
古语云:天下大势,合久必分,分久必合。可见,人类在漫长的文明发展过程中总结出来:合作是提高生产效率最好的办法。而细胞在多细胞生命体形成之初就已经明白了合作的重要性,各种细胞类...
Cell-ID发表在NBT上面:Genesignature extraction and cell identity recognition at the single-ce...
在我们进行生物信息分析的过程中,有些包必须依赖旧版本的R,有些则必须在新版本的R下才能运行。然而一个服务器上R的快捷方式只能对应单一版本的R,修改R快捷命令对应的版本则需ro...
###################################### 题目:单细胞数据的导入与质控 - Seurat 语言:R Author: YQ#########...
######################################################## 题目:1.聚类分析&maker define cluster...
所涉及的函数 Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...