写在前面 前述，写了一个推文，大体是《即日起「TBtools」关闭「高速插件商店」，让往事随风~》。简单来说，舍去了两个辅助插件安装的插件，因为时代已经不需要他们。我们选择了...
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「TBtools」与「用户」让所有人掌握基因差异表达分析，共表达网络分析，相关系数分析... -
PPI | 一键预测基因/蛋白互作网络三年过去，我们更新了至少300个版本，尽管现在标签只是 TBtools v1.110。今天除夕，给大伙送一个新春大礼包，TBtools 主程序新功能，「PPI Predict...
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随笔 | 最麻烦的不是不想干，而是想干却不知对与错
过去两周时间，卡在一个小分析项目上，过得不太好。原因简单，在我的认知里相关分析就是跑一两行命令就完事了。原本是交给本科生去干，当然本科生可能太忙了，于是交给硕士去干。给了方法...
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一文尝试解决水稻参考基因组下载
昨天发了如何一步下载水稻泛基因组的contig序列，就有小伙伴在后台问我如何下载水稻最新版日本晴参考基因组序列。由于我主要是研究拟南芥(Arabidopsis thalian...
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任何人！十分钟掌握Circos图绘制
写在写在前面的前面 我不喜欢调用外部程序，如果是简单的事情。我觉得应该用最简单的方式来实现。如果你只是想画一个简单的Circos图，perl？不用的。R？不用的。网页？不用的...
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基因选择压力分析 | Ka/Ks, Dn/Ds 大规模计算，更快更准！写在前面 来来去去，这个主题相关的，我已经写过很多个推文，甚至还包括与Raindy（福建农林高芳銮老师）合作开发和发表了 EasyCodeML。只能说，确实是一个相对常见但似...
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植物启动子-顺式作用元件-批量提取-预测-可视化分析写在前面 以前总看到问题是，基因结构可视化的问题；现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单，也比较玄乎，所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网，手上的...
