请问count数据怎么获得
DESeq找差异基因+火山图一 DESeq DESeq的原理是什么以后会慢慢补坑,这次先上代码. DESeq必须用count数据!!! 整理出表达矩阵,第一列为基因名,后面为count值。 接下来,把f...
你好,请问可以看一下你的文件内容吗
DEseq2new_rnaCounts 为count文件new_metaMatrix2 为样本分组文件group为new_metaMatrix2 中的一列 在读取数据的过程中,有两点需要...
你好,请问用bowtie2结果不产生.rev.1.bt2,.rev.2.bt2文件,只产生另外四个文件,是什么原因呢
[转] bowtie和bowtie2使用条件区别及用法---------------------------------------------前言----------------------------------------...
@小梦游仙境 是求热图颜色相反的代码😭
折腾了许久才复现出的WGCNA图-GSE106292你值得拥有前些天老大布置了WGCNA的作业:下载GSE106292 数据集的 Excel表格如何读入R里面,做出作者文章中那样的图,但是分组很复杂,需要去文章中找细节内容,老大jimm...
是求热图颜色相反的代码😭
折腾了许久才复现出的WGCNA图-GSE106292你值得拥有前些天老大布置了WGCNA的作业:下载GSE106292 数据集的 Excel表格如何读入R里面,做出作者文章中那样的图,但是分组很复杂,需要去文章中找细节内容,老大jimm...
求助,我的TOM矩阵可视化热图做完大部分都是红的,中间对角线上的高亮的,就是和传统教程做出来是相反的,代码也没有报错,百度看到有提问,但至今无人回答,整了一天都没明白😥😥
@無間鐘 急求😭😭
折腾了许久才复现出的WGCNA图-GSE106292你值得拥有前些天老大布置了WGCNA的作业:下载GSE106292 数据集的 Excel表格如何读入R里面,做出作者文章中那样的图,但是分组很复杂,需要去文章中找细节内容,老大jimm...
@無間鐘 请问什么代码
折腾了许久才复现出的WGCNA图-GSE106292你值得拥有前些天老大布置了WGCNA的作业:下载GSE106292 数据集的 Excel表格如何读入R里面,做出作者文章中那样的图,但是分组很复杂,需要去文章中找细节内容,老大jimm...
请问你解决了吗
WGCNA可视化热图显示问题菜鸟在学习WGCNA的时候,遇到了下面这个问题,目前仍未找到问题所在,同样的代码进行TOM矩阵可视化的时候出现了这种情况,我的高亮显示颜色和其他教程做出来是相反的,代码在跑的...
老师您好,我想问一下手上有转录组数据,要怎么处理之后可以进行WGCNA分析呢
STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
老师您好,我想问一下现在手上有转录组的数据,想做WGCNA分析要怎么转换数据呢,不知道WGCNA需要读入什么样的数据
WGCNA分析,简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,欢迎点击链接了解更多。 WGC...