240 发简信
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    FeaturePlot 对负值并不友好

      Seurat的FeaturePlot可以展示基因在降维空间里各个分群的表达情况,也可以展示metadata里面的数据情况,例如基因集打分情况...

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    riborex:差异翻译基因分析

      分析差异翻译基因时,为了保证结果的正确性,除了使用Xtail软件外,也用riborex分析了一遍,该软件封装了常规转录组常用的三种差异分析框...

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    Tips:ChIPseeker注释的peak文件不要随意命名

      ChIPseeker用来做peak注释体验感确实很好,所以也经常用,为此还特意包装了一个性化脚本方便命令行直接使用,后台也有不少人获取脚本,...

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    xtail | 差异翻译基因分析

      基因翻译,即遗传密码从转录本到蛋白质的过程,也是功能基因能够发挥自身作用前的必经之路。基因的翻译效率收到很多因素的调控,这其中最直接的是基因...

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    ChIPseeker个性化注释脚本修复

      之前的推文[个性化ChIPseeker注释peak结果[https://www.jianshu.com/p/f1307325d8a2]]里面...

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    TCellSI:巧用housekeeping genes矫正样本间效应

      TCellSI:一款借助Mann-Whitney U统计量,通过特定marker基因集和背景基因,对T细胞状态进行评估打分的软件。该软件能够...

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    PCA:这样应该懂了吧!

      在RNA-seq分析结果中经常会看到由两个主成分(PC1,PC2)绘制的PCA (principal component analysis)...

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    R tips:Seurat应该这么读取多样本

    "枪响了""看到是谁开的枪了吗""看不清,他站在道德的制高点上,他在阳光下。"                    ——温特伯格《狩猎》   ...

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