写在前面 很多时候,我们总是有「宏图伟略」。事实上,绝大多数设想和计划都是美好的,出问题常常其实是在执行环节。换句话说,不用那么复杂的设想,也不拥有那么完美的计划,因为决定最...
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一边学习,一边总结,一边分享! 详细教程请访问:组学分析流程[https://mp.weixin.qq.com/s/aL3xDQdkYXSCoXwvapQFtQ] 本期分析流...
记录下如何手动解决hifiasm 装单倍型失败的例子, 许多之前做过的分析,写过的脚本,没整理都有点模糊了,遇到同样的问题又要重新想一遍。所以还是对典型问题多记录一下,帮助自...
前言 最近在研究低深度WGS数据检测SV变异,测试了很多个软件,一直没有一个准确的结论。周一很巧地发现了这篇文章,作者收集了市面上几乎所有的SV检测工具,用真实数据和模拟数据...
这篇文章很长,超过1万字,是本系列中最重要的一篇,因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读,对于有一定经验的老手来说,相信依然可以有...
一、deepmod 1、三代测序得到的fast5文件是muti fast5,一个fast5文件里面有4000条fast5序列,deepmod不支持muti fast5,需要拆...
snakemake是一个用来编写任务流程的工具,用python编写的,因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂,易于理解。 一、从一个简单的例子开始 1、安装snakemake 安...
使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者对已有的工具进行很好的分...
基因组序列分析中,序列一致性指的是什么?[https://www.jianshu.com/p/1bafd29ba338] 上方为原文链接,下文是为了连接失效后备份学习查看,若...