240 发简信
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    几种标准化方法的学习笔记

    不管在RNA-seq还是ChIP-seq分析中,都涉及到一个概念,就是标准化。作为一个刚入门的小白,总是听王院长和其他熟悉生信分析的同学们强调标准化的重要性。 为什么说它重要...

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    测序的世界

    测序的世界很奇妙,不同的数据处理可能得出不同的结论,入门生信首先要做的就是了解你的数据还等什么?跟我一起来探索吧~ 测序原理: 早期如何测序呢? 如果给你这么一串珠子,让你统...

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    R包pheatmap绘制热图

    前言:欢迎关注微信公众号:生信天团本文微信连接:R包pheatmap绘制热图此文参考自B站孟浩巍的系列视频[1]代码,利用个人测序数据绘图,现学现卖,不足之处,请多指教; 1...

  • 用pheatmap画热图

    假装是前言 学了很久的R,一直也没啥进展,之前一直觉得R不是很容易的东西吗,复制粘贴代码就好了。。emmm,太年轻太年轻。。 我用R的日常就是画热图,各种各样的热图。所以网上...

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    STREAM:一款scRNA-seq拟时分析工具

    scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了,自2014年nature biotechnology提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析(Trajectory)已经有五个年头了。...

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    如何学习生信

    什么是bioinformatician 如何你想成为一名生信人,那么至少你需要了解什么叫做生物信息学。否者,朝着错误的方向再努力也是白费劲。 什么是生物信息学呢?在陈铭主编的...

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    转录组入门(5): 序列比对

    前言 比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2,并且搞懂它的用法。直接去hisat2的主页下载index文件即可,然后把fastq格式的r...

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    各基因组数据库

    基因组对应关系: 1.UCSC: table-browser:https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables ###############...

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    ChIP-seq详细分析流程

    参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载,到最终结果展示,具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。数据下载:数据存放地址关于环境...