你好,请问可以分享一下这个~/hychao/script/format_mergeFA.py么?感谢感谢!😄
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
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单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
请问juicerbox调整时候,右下角的没有挂载到染色体上的一些contig或者说scaffold这些需要删除么,move to debris选项没有变化,它们应该已经是debris了。我试过去除掉染色体边界,但是去不掉,只能都选中再去掉染色体边界,这些会变成一个染色体。
De novo组装#07 | 染色体挂载 (allhic,3d-dna)写在前面 初始组装经过基因组纠错(polish)以及去冗余(purge)之后,就可以将其挂载到染色体上,使其由contig/scaffold级别的基因组提升到chromoso...
请问脚本中的up和down变量指HSP的上下游的延伸长度么,这个长度一般根据什么信息指定呢?
基因家族:用python处理blast结果区域延伸的问题tblastn比对出来候选HSP区段,我们需要根据一定的基因长度范围来进行区域延伸去重叠,然后进行exonerate或者genewise建模。对HSP区域的延伸要考率基因的长...