转录组是一类让人既爱又恨的项目，实验门槛低，却是文章泛滥的重灾区，总有人问小编，现在转录组还能发文章吗？下面小编就借一篇2020年5月4日发表在BMC Genomics上题为...
发简信
IP属地：安徽
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2020年转录组文章到底有多难发？一文说明白！ -
TCGA|GEO可视化分析第2篇---KEGG|GO分析大全导读：之前讲了如何用筛选出的差异基因做做相关性分析。那今天我和各位小伙伴深入的讲一下：（1）如何用clusterProfiler做KEGG|GO富集条形图，气泡图；（2）如何...
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TCGA——数据整理（FPKM到TPM）
0.安装包 1、下载好HTseq-FPKM的TCGA数据 2、将所有文件夹下的压缩包复制到一个文件夹下 3、解压缩到同一文件夹#gunzip()函数 4、提取藏在metada...
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limma做RNAseq差异分析limma是一个很强大的用于分析芯片的R包，也可以用于RNA-Seq的差异分析以两个组比较为例：首先输入count表达矩阵，这里也跟其他差异分析R包一样，不要输入已经标准化的...
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R - 数据排序
数字列 如果索引是数字，可以按照其中一列或几列的值大小进行排序set.seed(13)data <- data.frame(test = paste0("test", sam...
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【Pathview web】通路映射可视化前言 pathview是一个通路可视化友好的R包，最主要的是它支持多组学数据映射（基因/蛋白-代谢）。自己用过它的R包，后来发现有网页版的，果断介绍给学员。因为不常用，记录要...
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GEO再学习-GSE42872GEO再学习 GEO数据挖掘已经成为生信学者必备技能,我以为自己会跑代码了就是会了,其实呢,细细去领会每个细节,还是会发现很多盲区.听了晓娟老师的课,发现很多很多细节我并不甚...
