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10X单细胞（10X空间转录组）基于马尔可夫过程和RNA速率的细胞命运预测（Cellrank）hello，今天我们来分享一个更加完善的单细胞轨迹分析的软件，cellrank，文章在CellRank for directed single-cell fate mappi...
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CytoTRACE 原理及代码解释CytoTRACE是一款基于单细胞计数矩阵推测细胞间活性和细胞间相对分化状态的一款软件，这里我们结合实际代码例子，解释CytoTRACE的数学原理： step 1:这一步先将...
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SCENIC: 单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络和细胞功能聚类作者：ahworld链接：SCENIC | 以single-cell RNA-seq数据推断基因调控网络和细胞功能聚类)来源：微信公众号著作权归作者所有，任何形式的转载都请联...
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CellChat：细胞间相互作用分析利器前言 我们知道，细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用，另一个通过细胞产生的可溶性小分子，即细胞因子。在单细胞数据分析中下游，有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
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单细胞综述之整合分析文章发表于nature review genetics：Integrative single- cell analysis，作者是Tim Stuart与Rahul Satij...
