WGCNA分析过程中,你可以得到edge和node的文件,里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值,根据这些值你可以将它们之间的...
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一、需要的数据 (1)eggnog对基因的注释(名字例如叫:egg.tsv) TSV格式 (2)ko00001.json文件 下载地址:https://www.genome....
这篇文章可以让你学到什么? 可以让你把这样的图: 通过设置各种参数修改为这样自定义的图: 一、 本文使用的数据 我们使用R内置的数据集Chickweight来进行画图的学习,...
安装并加载所需R包 基本用法 常用参数 加载并查看示例数据 基本数据格式: 前三列分别为SNP的名称,所在染色体,SNP的位置,后面每列为不同性状的P值,每个性状单独一列 默...
首先按下 ⌘Command + ⌥Option + I(Windows 为 F12)快捷键,召唤出调试界面。调试页面 按下 ⌘Command + ⇧Shift + P(Win...
简介 柱状图一般用于,当我们都有一组分类变量以及每个类别的定量值,而我们关注的主要重点是定量值的大小时。 应该在柱状图背景保留横网格线,便于比较我们关注的值。 当分类labe...
更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前,先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS结果的mapping,一般推荐...
什么是组间差异检验?就是组间的差异分析以及显著性检验,应用统计学上的假设检验方法,检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲,所有的差异检验都基于一个假设:组间没有差异,变量之...
概念回顾 Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为...