在R语言中运行Cibersort共需要三个文件,分别是(1)官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”;(2)自己的表达矩阵;(3)Cibersort代码。 (1)LM2...
IP属地:贵州
在R语言中运行Cibersort共需要三个文件,分别是(1)官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”;(2)自己的表达矩阵;(3)Cibersort代码。 (1)LM2...
参考教程:https://4va.github.io/biodatasci/r-rnaseq-airway.html#data_needed 数据来源 Himes et al...
由于实验需要,帮师姐画了一张折线图。特此感谢师姐提供数据给我锻炼的机会! 成品图如下 直接上代码 1. 读入数据 2. 计算标准差 3. 绘制折线图 结果如图所示,从图中可以...
1.初识ggplot2 1.1 功能 是一个作图包; 可以创建图表,如散点,柱状图,线图,将数据可视化; 1.2 要素 数据(Data)和映射(Mapping) 几何对象(G...
相分离或者说相变(Phase separation,Phase Transition)是目前比较火的一个研究领域,已有的研究表明相分离在细胞中普遍存在,与基因组的组装、转录调...
准备工作 这里进行包的导入 基因ID类型的转换 bitr转换 参数: x:基因ID向量 fromType:目前基因ID类型 toType:目的转换ID类型,可通过向量模式表示...
文档链接:https://github.com/taoliu/MACS/MACS2是ChIP-Seq、ATAC-Seq、DNAsel-Seq等分析中call peaks的常用...