您好,我使用fpkmToTpm公式将tcga下载的fpkm转换为tpm后,表达值变为从0到100左右,请问还需要log转换吗?还有请问fpkmToTpm公式是否就等价于fpkm*1e6/sum(fpkm) ?
简单小需求:如何将FPKM转换成TPM?刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析,得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性,推荐使用TPM。 read count和FPKM...
您好,我使用fpkmToTpm公式将tcga下载的fpkm转换为tpm后,表达值变为从0到100左右,请问还需要log转换吗?还有请问fpkmToTpm公式是否就等价于fpkm*1e6/sum(fpkm) ?
简单小需求:如何将FPKM转换成TPM?刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析,得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性,推荐使用TPM。 read count和FPKM...
感谢小学学! 测序原理: 将基因打断成片段reads;每段reads一端连接不同的UMI做为标识;PCR;测序 uniquely mapped reads:reads的唯一性...
Epithelial-to-mesenchymal transition is not required for lung metastasis but contribute...
200902 pcr扩增不出来目的片段,调整:降低样品浓度,增加样品溶解度,降低样品input量 不规范操作:摸索条件时同时改动多个参数,没有阳性对照和阴性对照 教训:摸索条...
前瞻性研究 前瞻性的研究(prospective study)是以现在为起点追踪到将来的研究方法,可弥补回顾性研究的缺陷。例如临床心理学实验中,对一批A型行为类型者使用自我行...
及时止损需要细心,时时观察和记录,尤其在做了不规范的操作,看到了不符合预期的现象时,必须详细记录,把现象解释清楚了再进行下一步操作,不然做多错多。 比如6月底开始做crisp...
实时荧光定量PCR 手册(Thermo Fisher Scientific):https://www.thermofisher.com/content/dam/LifeTec...
没有官方说法,但是大多数医生会以BRAF为准
如何看懂甲状腺穿刺结果甲状腺穿刺(FNA)是评估结节良恶性准确率最高的检查,但由于有创伤且费用高,所以并不适用于甲状腺癌的筛查,主要用于对怀疑恶变的结节进行进一步确认。 目前FNA结果一般按照Be...
你好,请问这部分内容出自的完整课程名称是什么?
【r<-生信|包】Biostrings在这篇文章中,我们将学习如何操控R中的字符串,主要用的是Biostrings包。 Getting started 如果你是第一次使用,请先用以下命令安装Biostrings包...
注释 如果要用最精简的话来概括生物信息学的工作的话那就是注释、统计与可视化。 大量的生物信息已经由生物学家分门别类收集到各种数据库中,在调用这些信息时,只需要提供所需信息对应...
基因表达检测方法 基因表达需要直接或者间接测量某个生物个体内全部基因的转录产物(指狭义的转录组即mRNA)在细胞中的丰度,常用的检测方法有:实时荧光定量PCR(qRT-PCR...
本篇文章介绍的序列分析主要是针对二代测序数据。 当前的序列分析主要包括以下方面:序列预处理、序列拼接、短序列映射和变异检测、序列比对和相似性搜索、分子进化分析和比较基因组学。...