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ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...

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01 基因富集分析基本概念 今天我们来讲一讲什么是基因富集分析 首先我们要抓住一个核心，那就是： “将我们挑出来的基因归归类，聚类分析，看看这些基因的功能和我们的研究是否具有...

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笔记内容：由二代测序产生的序列数据（.fastq）到OTU table， 距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的可分析数据，为常规分析流程。可以使用usear...

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ComplexHeatmap学习笔记①Introduction to ComplexHeatmap package ComplexHeatmap学习笔记②Making A S...

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LPSN全称List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature。源自1997，近期更新发表文章于2020。该数据库...

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由于论文问题，这里重做了mantel test，所以记录一下完整的重做过程。首先是运行语言，这路选择R语言作为计算语言。 1 package ggcor作者删除了账号，不知...

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主成分分析（PCA）是一种无监督降维方法，能够有效对高维数据进行处理。但PCA对相关性较小的变量不敏感，而PLS-DA（偏最小二乘判别分析）能够有效解决这个问题。而OPLS-...

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简介例1. 不同品种代谢产物OPLS-DA loading plot1 安装2 内置数据介绍 代谢物对个体性别的定性响应 - PLS执行PLS-DA结果参数解释模型评估常用可...

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之前我们了解了基于相关性进行的一些多组学关联分析。那么在SCI论文中，还有一些比较受欢迎的多组学联合分析方法——机器学习。接下来，小易带大家学习下多组学关联分析“重器”...

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转录组测序的最直接目的，就是设法寻找组间显著表达变化的基因，解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如，肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调，这些...

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嵌合体(Chimeras)是PCR阶段不正常的扩增过程所产生的序列。嵌合体由两条及以上的模板链组成，是PCR延伸阶段的不完全延伸造成的。 通常有1%的几率会出现嵌合体序列，而...