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脑转移癌相关髓系细胞大脑很久以来都被认为是一个免疫豁免器官，其含有的免疫细胞含量较少，但在一些病例情况下，例如肿瘤，就会导致免疫细胞的异常浸润，其中从血液中迁徙过来...
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脑部肿瘤的免疫微环境图谱2020年，来自瑞士洛桑大学的Johanna A Joyce团队通过全面对比不同类型肿瘤的免疫微环境，展现了不同类型脑肿瘤的免疫浸润特点，回答了...
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GATK下游VCF maf可视化
VCF可以通过不同的上游分析获得，在格式上又有一些不同，盲目转化会带来很多问题。查看VCF文件内容可知是通过GATK上游处理得到的。 为了对变异...
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RNA seq上游分析（简洁版）
环境配置 质检 去接头 比对 得到count值 最终会在目标文件夹下面获得两个文件，counts.txt和counts.txt.summary。...
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单细胞测序揭示巨噬细胞和小胶质细胞动态竞争关系今天介绍一篇有关于单细胞揭示在胶质母细胞瘤中，大脑原位的髓系细胞（小胶质细胞）和血液来源的单核-巨噬细胞的动态竞争关系。 背景 免疫检查点抑制剂...
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非小细胞肺癌微环境免疫模式用以肿瘤分型和病人分层2021年，Leader等人通过目前最大的非小细胞肺癌的单细胞测序和CITE-seq，对非小细胞肺癌的微环境进行了多组学的分析，最终构建了一个包...
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乳腺癌骨转移微环境辅助精准治疗最近看到一篇单细胞与临床相结合的文章，通过乳腺癌骨转移的肿瘤微环境，提示肿瘤的精准治疗。发表在Ann Oncol. 作为一个临床医生，本文的实验...
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GSE120974多组学分析复现0.数据介绍 这是一篇发表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...
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001-单细胞时序性追踪探究肺癌中PD-1疗法对耗竭T细胞的效应本文是北大张泽民教授团队2022年的新作，通过T细胞谱系追踪的方式，探究PD-1疗法对于肺癌中免疫微环境的影响。 背景 免疫检查点抑制剂通过阻滞...