发简信
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@贼菜但是想顺利毕业
安装python 模块 pip install csvkit
然后csvcut -t -c 列名1,列名2 文件名| csvformat -T >ouputfile 注意：-t代表tab分割，
例子:
csvcut -t -c columnname1,columnname2 filename |csvformat -T >outputfile
这种方式也比较适合小文件，大文件速度会慢些👢[linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行
一、待解决问题 A文件如下所示。tip:ID列指的是图中带红框的那列,A大小73.1MB、B大小约1GBimage.png B文件是从网上下载的注释文件"GCF_000001...
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grep -w -f file1 file2会比较简洁一点
如果file是在win底下构建的,最好使用 dos2unix file 来将换行符换成linux下的换行符👢[linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行
一、待解决问题 A文件如下所示。tip:ID列指的是图中带红框的那列,A大小73.1MB、B大小约1GBimage.png B文件是从网上下载的注释文件"GCF_000001...
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grep -w -f file1 file2会比较简洁一点
如果file是在win底下构建的,最好使用 dos2unix file 来将换行符换成linux下的换行符👢[linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行
一、待解决问题 A文件如下所示。tip:ID列指的是图中带红框的那列,A大小73.1MB、B大小约1GBimage.png B文件是从网上下载的注释文件"GCF_000001...
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运行不通的缘故有可能是由于win和linux里的换行符不一样（win传过去的文件的换行符好像是^M）
real_id=`echo $id| cut -d"^" -f1`是只取win换行符前的部分，这行看情况用👢[linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行
一、待解决问题 A文件如下所示。tip:ID列指的是图中带红框的那列,A大小73.1MB、B大小约1GBimage.png B文件是从网上下载的注释文件"GCF_000001...
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grep -w 精确匹配
👢[linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行
一、待解决问题 A文件如下所示。tip:ID列指的是图中带红框的那列,A大小73.1MB、B大小约1GBimage.png B文件是从网上下载的注释文件"GCF_000001...
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人生几何，何不Python当歌？学习Python之路，始于爬虫，限于文本，忠于数据分析。目前文本和爬虫刚刚入门，数据分析还未真正开始。<br>公众号：Python攻城狮<br><br>博客地址：<a href="https://ask.hellobi.com/blog/zhiji" rel="nofollow" target="_blank">https://ask.hellobi.com/blog/zhiji</a><br><br>掘金：<a href="https://juejin.im/user/5a30fe44f265da4324807186" rel="nofollow" target="_blank">https://juejin.im/user/5a30fe44f265da4324807186</a><br><br>Github：<a href="https://github.com/ReainL" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/ReainL</a><br><br>大人不华，君子务实。<br>转载请保留原文链接及作者。
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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我刚测试了一下，可以下载，你再捣鼓捣鼓看看
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⑨📚[目录-文集类]生信数据库文集~目录------更新于20191217
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