发简信
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pySCENIC的转录因子分析及数据可视化（三）参考生信技能树：pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
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Needleman-Wunsch 算法及实现Needleman-Wunsch (NW) 算法常用于基因序列匹配以及单词匹配，是一种实现全局最优匹配的动态规划算法。其最差情况下的时间复杂度是, 空间复杂度是，其中和是两个...
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免疫治疗结果与风险关联的直方图1.需求 为了直观的展示免疫治疗结果与病人风险高低之间的关系，如图： 2.数据 需要病人的高低风险分组，和免疫治疗结果 3.画图代码 因为数据是编的，就不用看high和low...
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免疫细胞注释-1：T细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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思路清奇SCI:07.糖酵解基因+ccRCC(4+分）PMID: 杂志：Frontiers in Oncology 背景 作者通过对正常/癌旁与肿瘤组织进行GSEA分析发现5个糖酵解相关通路（glycolysis）在肾透明细胞癌...
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思路清奇SCI:19.免疫相关eRNAs+HCC.4.59分免疫分析在肿瘤中一直是非常hot的“热点”，围绕免疫又出现了一波热潮，如免疫分型、免疫相关lncRNA等，今天在看文献时，发现又出现了新的热点免疫相关eRNA。下面就来分析下...
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思路清奇SCI:18.HRDscore+CXCL10+乳腺癌.11分同源重组缺陷评分（HRD score）是乳腺癌（BRCA）研究的热点区域，如果跟免疫扯上关系呢？下面就来学习下这篇HRD score+单基因CXCL10+乳腺癌高分文章吧。 ...
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思路清奇SCI:14.干扰素-γ相关基因+肺癌PMID: 发表杂志：Aging (Albany NY) 知识点 IFN-γ: Interferon-gamma,干扰素-γ。 背景 在细胞因子如IL-2、IL-12等的诱导...
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使用ggplot2和ggrepel包做火山图我是个R新手，只会简单的画一些图，还不能随心所欲的画图。Hadley Wickham男神的ggplot2包以及tidyverse超级大包真是让人膜拜！最近实验室留学生让我帮他...
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R语言代码-绘制SCI发表级的nomogram及calibration图需求描述 画出paper里的nomogram图和校准曲线 出自https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1470-2045(...
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R语言ROC曲线绘制01-survivalROC作者：白介素2 相关阅读：R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpub...
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Seurat包合并多个单细胞样本示例数据：GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
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miRNA的下一个研究浪潮？A-to-I edited miRNA走起！
提到非编码RNA，大家最熟悉的就是miRNA, miRNA靶基因研究，miRNA-lncRNA研究等等。小编最近发现了一个miRNA的新研究：A-to-I edited ...
