刷了机,安装好conda环境后conda又疯了。conda install -y samtools hisat2 bowtie2 bwa htseq bowtie报错开始 ...
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刷了机,安装好conda环境后conda又疯了。conda install -y samtools hisat2 bowtie2 bwa htseq bowtie报错开始 ...
虽然是做生物信息的,但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症,于是把这些乱七八糟的东西整理了一下,强行写了一篇小文章。东西太杂,但是彼此相关,实在想不到什么合适的...
今天介绍如下三点内容: PCA是如何计算的 如何计算每个PC所能解释的方差 特征值与PC解释方差比例的关系 1. 使用R语言自带函数prcomp计算PCA 并计算每个PC所能...
忽略矩形中的蛋白颜色,但不要忽略箭头的颜色 均手工绘制,通过查阅文献还有KEGG综合所画,错误在所难免。可留言。参考文献众多,不再一一列出。 ----------------...
2018年8月份的时候,我也使用过seurat来分析单细胞测序数据,然后最近也需要使用seurat包来分析实验室的单细胞测序数据,在R中安装完seurat的包后,我到网站上下...
相关性分析用于评估两个或多个变量之间的关联性。 1. 两个变量的相关性分析 参数相关性检验( parametric correlation ) 皮尔森相关性分析是一种参数相关...
把RNA-seq(2)-2下载的sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量,理解各指标的意义。 1 数据解压:用samtools中的f...
简介 Markdown 是一种轻量级标记语言,它用简洁的语法代替排版,使我们专心于码字。它的目标是实现易读易写,成为一种适用于网络的书写语言。同时,Markdown支持嵌入h...