1：在线构建RAxML树 1. CIPRES网站： CIPRES Science Gateway V3.3[http://www.phylo.org/index.php/po...
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在线和本地两种方法构建 RAxML 进化树方法和解读 -
【ProteoWizard MSConvert】质谱文件格式简介及其转换质谱格式 质谱文件格式多种多样，各仪器厂商产出的数据都有不同。虽然HUPO已经对质谱数据进行了标准化，但大家依然是我行我素，因为不得不用它们提供的软件，而不同的软件会要求不同...
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使用EGGNOG-Mapper对非模式物种快速进行GO或KEGG注释对于非模式物种，需要做GO或KEGG富集，可以尝试使用EGGNOG-Mapper来对你的物种序列进行快速注释。在注释结果文件中，可以同时获得序列映射上的GO号或KO号，直接提...
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Linux下miniconda的安装使用
Anaconda与Miniconda的区别 Anaconda是一个打包的集合器皿，里面预装好了conda、某个版本的python、众多packages、科学计算工具等等，所以...
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miniconda的常用命令汇总
写这个的目的主要是年纪大了，老是记不住命令行，索性整理下来，忘了就不用满世界找了。 和channels有关的命令 查看已经添加的channels 增加channels 有时候...
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基因的可变剪切(alternative splicing)和蛋白异构体(Protein isoform)写这个文章的原因是因为我在用Trinity组装转录组的时候，除去软件的原因，在生物体内有很多的可变剪切现象，定义就是一个mRNA前提可以通过不同的内含子出去方式获得成熟的mR...
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如何区分基因的显性效应(Dominance effect)和上位性效应(Epistatic effect)基因的上位性效应和显性效应听名字就觉得挺绕的，听起来就是一个基因对另一个基因的压制效果，网上的介绍看起来云里雾里，还搬来染色体，标记的性状，感觉更加复杂了。 基因的显性效应 ...
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建立者效应(founder effect)和瓶颈效应(bottleneck effect)我对种群遗传学这块一直不太熟悉，奈何实验室中经常有需要涉及到种群进化这块的内容，所以以下的这块介绍，大抵将给我自己听的。 建立者效应 建立者效应是指少数个体的基因频率决定了他...
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如何用fasq-dump解压SRA文件
之前介绍了如何安装sratoolkit, 可以看我之前写的简书https://www.jianshu.com/p/188df05615c7[https://www.jians...
