我的2019年终总结木有写，2020的大事又不多，不妨写在一起吧。 2019年 2019年我以新人讲师的角色随团队一起全国巡讲，21场线下培训我参加了19场，还有几次本地开班...
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RMarkdown基础知识RMD方便整理笔记、输出代码，和.R文件不同，可以视为高级脚本 一、RMD组成 RMD由三部分组成：头文件、代码块、正文1、头文件：用---分割线和下面分开，其中output...
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从官网上下载TCGA数据不知从TCGA下了多少次数据了，每次都像失忆了一样重新研究……果然凡事都该动笔记下来 TAT本次以肝癌数据为例操作系统：MAC OS 1. 登陆TCGA网站 https://...
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本号停更
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转录组分析——四、数据质控
数据质控：fastqcfastqc软件可以对fastq格式的原始数据进行质量统计，评估测序结果，为下一步修剪过滤提供参考 fastqc的常用参数 -h 打印fastqc的帮...
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转录组分析——三、sra转换成fastq一、背景知识 1、sra数据 sra数据是SRA数据库用于储存二代测序数据的原始数据的一种压缩格式，这种数据格式不能直接进行处理，需要转换成fastq才能进行质控以及去ada...
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转录组分析——二、数据完整性检验
一、md5值检验 md5值检验需要用到的东西1、一个txt文件（第一列为md5值，第二列为sra文件名，两列中间有两个空格，固定格式）2、下载好的sra文件3、txt文件和s...
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转录组分析——一、工作目录搭建及SRA文件下载一、准备工作-目录管理 一句命令同时创建多个同级别文件夹，规律存放，方便溯源几个文件的作用分别为“软件安装，数据库存放，流程搭建目录，项目分析，数据备份” 二、数据下载 流程...
