随着基因组测序技术的不断发展,越来越多的物种已完成全基因组密码的破译,在基因组信息全面解析的基础上,对于某物种的功能基因定位,驯化等相关深入研究具有重要意义。然而在漫长的物种...
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随着基因组测序技术的不断发展,越来越多的物种已完成全基因组密码的破译,在基因组信息全面解析的基础上,对于某物种的功能基因定位,驯化等相关深入研究具有重要意义。然而在漫长的物种...
写在前面 基因组组装完成后,我们需要对我们组装好的基因组进行一个质量评估,质量评估主要从连续性(continuity),完整性(completeness),准确性( accu...
这里有一份群体的学习课程,这篇推送主要基于这个作为参考,群体课程[http://www.uwyo.edu/dbmcd/popecol/index.html]Fst值[http...
写在前面:当学习某一重要文件格式时,更需要对此格式对应软件工具进行全面的学习(如sam/bam——samtools)。在多次花时间写脚本处理文件之后发现,80%左右的任务其实...
ABBA-BABA分析方法最早发布于2012年NATURE的文章:Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimic...
Complement(cDNA):mRNA的cDNA,与原来的基因组DNA相同而且无内含子;相反地,对应于在原来基因中没有的而在mRNA存在的3'末端的poly A序列等的核...
最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图,所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全称是什么? A: 高通量染色体构象...
不同的结构变异(structural variation,SV)鉴定工具鉴定出的VCF结果文件格式不尽相同,但也不是完全没有规律可循,主要的格式就有两种,分别是: BND n...