昨天我在单细胞天地讲解了使用monocle2进行拟时序分析的方法，基本上跟着我的代码走一波就可以学会了，当然具体参数理解需要自行发力哦，见：使用monocle做拟时序分析（单...
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拟时序分析的热图提取基因问题 -
求问，这个和find.anchord的区别是什么😬，刚学了这个函数，不明白，请教一下
单细胞多样本整合（同批次）
单细胞前期工作重要的是如何将测序得到的多样本整合同步分析： library(Seurat) folders=list.files('./') #列出文件夹 folders=f...
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所以怎么获取呢😬
点点点 | 真香！Simple GO GSEA 富集分析 ~
写在前面 时间拨回去 2015年，那时我接触生信已有一年，TBtools 开发尚在萌芽阶段。那会，我写了几款小的软件，包括 “blast3go”，为的是应对即将收费的“bla...
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python，awk，shell格式化输出内容全解
话不多说，直接开始 python的格式化输出 (一)用 {} 花括号 格式化的关键字是 .format(要格式化的内容） eg： （二）%格式化操作 %s 替换的是所...
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这个还真没注意，这个readout代表什么。重复率？是测序结果不好吗？
数据分析2-.sra数据拆分与过滤
1.拆分 >fastq-dump --gzip --split-3 SRR6449842 2.fastqc质量检测 参考：https://zhuanlan.zhihu.com...
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@wo_monic 我已经成功了
qsub任务提交系统
qsub系统适用于服务器集群的任务提交参考地址 qsub提交系统使用说明 运行命令 qsub run.s PBS的walltime于qsub -a 的时间格式是不一样的 #P...
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退出了交互式终端,如何再打开这个终端
PBS 作业管理系统
在上一篇中我们非常简单地介绍了在 C 语言中嵌入 mpi4py 程序的方法。 前面我们所给出的各个例程一般都是在单台计算机上直接使用 mpiexec 或 mpirun 执行的...
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你好,提交R作业时,可以创建成为交互式的作业,用类似于在R console终端操作的方式进行操作吗?
qsub任务提交系统
qsub系统适用于服务器集群的任务提交参考地址 qsub提交系统使用说明 运行命令 qsub run.s PBS的walltime于qsub -a 的时间格式是不一样的 #P...
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数据分析4.1-STAR_的简单使用
1.构建参考基因组的索引 1.1以小鼠的基因组为例，首先下载参考基因组与基因组的注释文件 wget http://ftp.ensembl.org/pub/release-10...
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数据分析3.1-stringtie 注释新基因-鉴定lncRNA
stringtie -p 16 -G /apps/users/zebrafish/Danio_rerio/pkd2/Danio_rerio.GRCz11.102.gtf –B...
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数据分析2-.sra数据拆分与过滤1.拆分 >fastq-dump --gzip --split-3 SRR6449842 2.fastqc质量检测 参考：https://zhuanlan.zhihu.com...
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数据分析1-使用ascp下载高通量测序数据.sra
1.下载安装ascp； win10现在可以安装wsl，下载数据到本地非常方便。我使用的是Ubuntu 18.04.在特定目录下载安装ascp wget http://down...
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@春卷00 谢谢
坑队友系列：ftp协议下载ensembl参考基因组
你问我为啥标题这么长，据说是关键词给的多，容易被搜到。写得不好，不用海涵，直接提出，谢谢您呐~ 1. 前言： 没错，作为一个自以为入门了的人其实还在门外。根据达克效应图解，充...
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@假装挖金矿的狮毛 谢谢
clusterProfiler: 分析+可视化GO和KEGG富集的转录组R包
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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问一下 ensemble 中 基因组 rm sm以及没有后缀的，三种情况分别是什么意思？求解！！！
坑队友系列：ftp协议下载ensembl参考基因组
你问我为啥标题这么长，据说是关键词给的多，容易被搜到。写得不好，不用海涵，直接提出，谢谢您呐~ 1. 前言： 没错，作为一个自以为入门了的人其实还在门外。根据达克效应图解，充...
