导读 主成分分析(principal component analysis,PCA)是将多个变量通过线性变换以选出较少个数重要变量的一种多元统计分析方法,是常用的数据降维手段...
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转自:http://www.bio-info-trainee.com/2043.html 提到normalization很多人都烦了,几十种方法,而对于芯片或者其它表达数据来...
round(x,n):x的约数,精确到n位 table(x):返回一个由x不同值个数组成的表格(通常用于整数或因子),即频数表 prop.table(x,margin=):根...
一. 示例数据准备 下载:链接:https://pan.baidu.com/s/1tKR943efKOn7-TW_892KLg提取码:wbk6 文件说明示例数据,其中数据均为...
刘小泽写于2020.5.28Ensemble转Symbol其实不是这么简单,问题百出,需要留意 0 今天遇到一个需求,先来看看 有这样的四个文件,每个文件中都有两列Ensem...
忙碌于实验的一周。写代码的时候是只要写代码就要动脑子,最简单的读文件,也是要小小动一下脑子。而做实验的时候是计划实验的时候动脑子,实验中机械操作,然后实验失败的时候是费脑子。...
之前分析TCGA数据都是直接匹配barcode,其规则懂的不多。相信有不少同志也有这方面困惑。 这里给出两份资料,一份是TCGA官方英文介绍,链接为https://wiki....
思路 首先要依据临床特征建立分组,无论是复发vs原发还是TNM分型中的T/N/M。将肿瘤每个样本的表型特征,与表达数据矩阵一一对应到同一张表格里来,随后再用作图工具出图。因为...
TCGA数据的另一个重要的包:RTCGA参考学习资料:TCGA之miRNA预测临床表现RTCGA(1) 数据概况与数据下载RTCGA(2) 数据分析与可视化https://w...