发简信
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有了这八个网站，帮你找到90%的电子书首先感谢各位的厚爱，许久未来，却得到如此多的支持。 所以我又重新筛选了一遍，替换走失网站，新增网友要求的英文网站。 1、鸠摩搜索（https://www.jiumodiary...
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可视化文章集锦(套路、配色、编辑、在线工具、R、CIRCOS、Cytoscape)
数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功底，能否达意是最基本的要求---最合适的图示和配色表达最直观的含义。 本文整理了关于可视化套路 (什么...
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互联网、思维、生活感悟<br>个人主页：<a href="https://stormsha.com" rel="nofollow" target="_blank">https://stormsha.com</a>
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CSU大三<br>微信公众号：月小水长（ID:inspurer)<br>交流群：861016679<br>个人网站: <a href="https://inspurer.github.io" rel="nofollow" target="_blank">https://inspurer.github.io</a><br>原创作品，已授权维权骑士，转载请私信
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Shiny文档翻译-a.02 使用isolate()阻断响应
翻译自：Stop reactions with isolate()转载请注明来源 响应阻断器：避免依赖 有的时候，对于一个observer或响应终端而言，具备访问响应值或响应...
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发明者 - 筑就非凡的量化世界
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R语言ggboxplot-一文掌握箱线图绘制所有细节作者：白介素2相关阅读：R语言ggplot2绘制箱线图R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR...
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从Keras开始掌握深度学习-4 通过TensorBoard分析模型前言 TensorBoard是一个机器学习的可视化工具，能够有效地展示Tensorflow在运行过程中的计算图、各种指标随着时间的变化趋势以及训练中使用到的数据信息。通过使用...
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从Keras开始掌握深度学习-5 优化你的模型前言 在第3篇教程里面，我们所编写的CNN进行分类的模型准确度达到了80%。对于一个分类模型来说，80%的准确率不算很低了。但是，在现有的情况下，我们应该如何优化这个模型呢？...
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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关于ML的模型选择的验证集与交叉验证的疑惑与解答
之前粗略的读过西瓜书的关于模型的评估与选择这一章 关于对模型的泛化性评估，以为无非就是分为训练集和测试集，分别用来训练模型以及计算误差。 再往下看，什么交叉验证法、留出法.....
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请问一下FilterMutectCalls后的结果怎么理解，在经过这一步处理之后，filter这一项没有PASS，只有artifact_in_normal;base_quality;clustered_events;panel_of_normals;read_position之类的，出现的最多的是‘.’，这是什么意思，是一个位点都没留下来？
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你好，我想请教一下：
1、deepvariant获得的结果不使用hap.py直接进行下游分析是否可行，会推荐使用PASS的位点么？
2、如果要用hap.py，对于全基因组真集应该选择什么文件，af-only-gnomad.raw.sites.hg19.vcf.gz可否？
3、另外hap.py获得的结果filter列都是点号，是否已经删除了它认为找的不正确的位点？
盼望解答，非常感谢。DeepVariant — step2 DeepVariant下载及测试
一、DeepVariant的下载 1.官网推荐步骤 dokcer版本的deep-variant的使用（DeepVariant 的用法 Github上面介绍的很详细）：http...
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@波若流殇 在deepvariant手册里找到说不推荐BQSR，会损害deepvariant的准确度，所以我改了策略了，特此说明，防止误导旁人😃
DeepVariant — step3 DeepVariant、GATK、Sentieon的比较
找了一组数据，是100个基因的小panel的bam文件，用DeepVariant、GATK、Sentieon三个软件分别call SNP/INDEL，最后做一下比较。bed文...
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感谢博主，加深了我的理解，最近在总结原理方面的东西。我觉得第二个步骤应该是预训练的模型加上已知基因型样本加上该未知样本再训练后获得的CNN模型。
另外我想请教一下，deepvariant找的是种系突变还是未加区分？如果想找体细胞突变，目前是不是只有用GATK4明确指定的工具Mutect2？
盼望解答，谢谢。DeepVariant — step4 DeepVariant 三部曲
Deepvariant是google 推出的基于CNN（convolutional neural network，卷积神经网络）算法，图像识别的变异检测软件。 参考的有关De...
