写在前面 当完成了对scRNAseq数据的Normalization和混杂因素去除后,我们就可以开始正式分析了。😘本期我们介绍一下常用的聚类方法(clustering),主要...
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参考自:https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/semantic-similarity-overview...
走到这里,也代表热图这个系列到最终篇了。最后我们说说一些奇形怪状的热图。其实小编也发现,生物学现在整的不太好的一个方面就是发论文大家太注重图了,反倒忽略了数据的价值。我是认为...
Rstudio-非常强大的IDE Rstudio是专注于R统计语言编程环境的IDE,基本取代了原生的操作界面而成为目前使用范围最广泛、功能最强大的编程软件。我们在可视化操作...
Y叔的clusterProfiler 升级到4版本了,所以试用一下它的内容,其实文章都有写,我就是简单copy一下文章中的代码。 如果直接安装安装不了的话,就使用本地安装吧 ...
Q&A | 如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析 [TOC] Question 有朋友在后台提问:在使用clusterProfiler做富集...
实在懒得找meme了 GOrilla, clusterProfiler, topGO 分析 ranked gene list (GSEA) 对比 Genelist prepa...
前言 Immugent在之前的推文:整合多组学数据进行分型之MOVICS[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&...
之前我在简书上写了一篇"如何只下载TCGA肿瘤或正常标本的count[https://www.jianshu.com/p/ebbd22a36d3b]"的教程,原以为没什么人看...