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    转录组分析中的免疫浸润的评估方法

    注:本文仅讨论转录组数据中的免疫浸润评估。关于免疫浸润的计算,其实有不少综述进行过总结。笔者看到过2篇发表于2018年的相关综述(虽然现在都20...

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    生信知识补充

    目前研究转录组的方法主要三种:(1)基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片;(2)基于sanger测序法的SAGE (serial anal...

  • 文献阅读专题

    第1篇 原文:Integrative analysis of gene expression and DNA methylation throu...

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    跳出套路的生信分析

    第1篇 原文:High-dimensional single-cell analysis predicts response to anti-P...

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  • 常用模型使用简介

    XGBoost xgboost入门与实战(原理篇)的后半部分介绍了需要注意的参数和基本使用方法。神器xgboost简单入门和运用手把手教写出XG...

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    非编码RNA生信分析

    第1篇 发在Journal of Translational Medicine(4分)。原文:Circular RNA regulatory n...

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    甲基化套路

    和甲基化有关的。可以先了解下甲基化:450k甲基化基础450K甲基化芯片数据处理传送门450k甲基化芯片常用工具包:ChAMP和minfi等。 ...

  • 生信数据库

    最常使用的数据库是TCGA和GEO,网上有一些不错的博客介绍了如何使用这两个数据库,本文不再赘述,直接贴链接吧。 TCGA数据库:TCGA-GD...

  • 生信实战通道

    笔者先前沉迷于算法原理研究,科研转化效率低下。痛定思痛,新开启简书账号,记录生信实战套路。本系列不纠结于算法原理,纯粹功利实战,套路优先。专注于...