发简信
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🤒 simplifyEnrichment | 让我来做你的富集结果的瘦身教练吧！~写在前面 最近真是烦心啊，事事不顺，找个日子我要找大师算一卦。😂 大家基本都会做富集分析，但有时候terms实在太多，读起来真是累，也搞不清到底谁是其中相对重要的。🥲 之前有...
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深入理解R包AUcell对于分析单细胞的作用首先我们来看看对AUcell的介绍AUCell可以识别单细胞RNA序列数据中具有活跃基因集（例如signatures，基因模块...）的细胞。 AUCell使用“曲线下面积”...
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单细胞转录组及空间转录组学习资源
(1). 单细胞上游软件cellranger：单细胞上游软件cellranger从头说[https://www.jianshu.com/p/9a09f7ad9d93] (2)...
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tidyHeatmap（一）：带你绘制高端热图
前言 Immugent最近注意到，生信宝库好久没有更新有关基础绘图的推文了，于是专门去找了最近常常碰到的专注于绘制热图的tidyHeatmap包的教程来学习了一下，现在分享给...
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2023-05-21-scRNA之GSVA SCORE的热图形式展现(GSVA可视化，pheatmap，癌症通路)对于热图，之前有画过，但当时对于繁多的arguements了解的不是很清楚，但是今天在微信公众号上找到了一篇真正的保姆级教程，讲的非常的详细！！！然后自己做了一点补充与拓展，...
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【单细胞转录组】UPhyloplot2绘制肿瘤进化的系统发育树目的：绘制肿瘤进化的系统发育树 参考文章 【官网】https://github.com/harbourlab/UPhyloplot2[https://github.com/h...
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编程笔记7-R语言和python函数对应表
R语言函数Python/Pandas函数功能table(x)x.value_counts()计算x中唯一值的频率rbind(df1,df2)pd.concat([df1, d...
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从中国核酸数据库GSA下载单细胞数据第一次使用GSA大约是2018年，那一次是往该数据库上传数据。 单细胞数据呈指数增长，对一个实验室也好，对一家科研单位也好，对一个国家也好，数据的管理显得日益重要。数据管理在...
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非生信人员做单细胞数据分析的入门秘籍写在前面 自2009年第一篇单细胞转录组文章发表以来，经过十多年的发展，各研究机构和生物公司相继推出单细胞RNA测序(scRNA-seq)服务，这使得单细胞测序已经从“王谢堂...
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10X空间转录组的边界转换效应作者，追风少年i hello，又是新的一周，2022的下半年，疫情虽然没有完全过去，但是基本已经控制住，对于我们而言，艰难的2022是必须熬过去的砍，没有撤退可言，希望我们无...
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10X空间转录组数据分析之细胞百分比饼图的绘制作者，追风少年i 最近一直有人问我空间转录组的饼图该如何绘制，如下图 之前呢，说过一些，大家可以借鉴 10X空间转录组绘图之细胞类型百分比饼图和空间密度分布图[https:/...
