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  • @杨博士聊生信 看着南海岛屿的数量好像有点少,我也不太确定。我用Arcmap画的岛屿看着多一些。师兄,你这个GIS文件是不是好多年前的?

    Map--R绘制中国地图(一)

    今天是国庆节,是祖国母亲72华诞,忍不住心潮澎湃,画一幅中国地图,以表拳拳之心。 今天我们使用R语言来绘制中国地图。 Step1:准备工作 这里我们需要提前下载几个R包。 自...

  • R的中国地图好像版图有点问题

    Map--R绘制中国地图(一)

    今天是国庆节,是祖国母亲72华诞,忍不住心潮澎湃,画一幅中国地图,以表拳拳之心。 今天我们使用R语言来绘制中国地图。 Step1:准备工作 这里我们需要提前下载几个R包。 自...

  • 我也出现了这个问题,请问你解决这个问题了嘛?😭

    如何使用snpEff创建本地数据库

    snpEff的使用是在Linux系统中Java运行环境下。 一、下载snpEff 方法一: 直接在家目录下载使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...

  • 请问可以一次性画多个省份吗?该怎么写呀

    R地图系列(1):maptools包绘制中国地图

    需要准备的数据 绘图之前需要准备加载的三个包,没有安装的同学可以先安装: library(maps)library(mapdata)library(maptools) 需要准...

  • 您好,请问如果我bismark --bowtie2比对指定产生的sam文件,后来deduplicate_bismark去重复默认产生bam文件,使用bismark2summary汇总样品信息时,无法检测到bam文件。输入bismark2summary命令,显示如下:
    No Bismark/Bowtie2 single-end BAM files detected
    No Bismark/Bowtie2 paired-end BAM files detected
    No Bismark/HISAT2 single-end BAM files detected
    No Bismark/HISAT2 paired-end BAM files detected
    请问这种情况怎么解决呀?谢谢

    bismark 识别甲基化位点-可视化篇

  • 毕业论文

    数据处理 BSA的变异,分析,找出不利变异,分析变异结构。 可变剪切的分析,参考https://www.jianshu.com/p/ecef1d9e53e7 Cytoscap...

  • 120
    为什么说FPKM和RPKM都错了?

    这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文,一些偶然的机会,发现不少朋友也在讨论这个问题,因此我重新做了梳理并发出来。这样的讨论是有益的,放在今天也不过时,我也愿意和更多的朋友...

  • 请问一下,我运行gatk HaplotypeCaller的时候,log file里全是
    WARN StrandBiasBySample - Annotation will not be calculated, genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null,这是什么原因呀?应该怎么处理呀?

    gatk报错整理

    gatk -V gvcf报错 报错内容 报错原因:gvcf同目录下缺少idx文件解决方法:复制过来上步骤和gvcf一起生成时候的idx文件过来 gatk安装调用报错 在没激活...

  • 这个系列咋停更了呀?

    BSR-(RNA-seq)数据进行BSR分析

    使用工具GATK4。GATK基础RNA-seq分析完整版BSR参考GATK官方RNA-seq calling流程最新版的BSR分析流程流程参考WT 3个单株,混池。三个技术重...