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R语言PCA画图 -
转录组数据绘制PCA图以及生物学重复的相关问题
很久没有跟新啦~~~忙着基金。。基金。。还是基金，然后就是文章。。文章。。还是文章。终于有空整理之前的东西。 说绘图方法之前先要了解，转录组的PCA图的意义是什么？为了检测样...
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R 稳健PCA分析稳健PCA，就是一种通过构造稳健的均值向量和稳健的协方差矩阵的主成分分析方法，其目标是从输入矩阵中去除稀疏缺失并获得低秩近似，可以有效消除数据集中异常值的影响和提高寻找大型数...
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CRISPResso2-基于高通量测序的靶点分析软件
鸽了好久，这段时间一直忙于毕业论文、投文章、博士申请和课题设计，总算都有了着落。今儿这内容也是实验室有需要就做了一下，前面加Barcode、混池测序就不说了，很多公司都清楚，...
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【R>>ssGSEA】制作GSEA需要的gmt文件GSEA文件有8类基因集，基本上可以解决80%-90%用到的问题，当然，我们都还有个性化需求，这个时候就需要我们自己动手啦。先来观察下GSEA需要的gmt文件格式(h.all...
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NBIS系列单细胞转录组数据分析实战汇总Single cell RNA-seq analysis workshop 该系列课程由瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 负责设置，为瑞典Phd学生，博士后，研究人员和...
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RNA-Seq：差异表达分析案例白利合子酵母菌在乙酸或铜胁迫下早期反应的转录谱分析 摘要：醋酸在食品工业和生物技术中是非常重要的微生物抑制化合物，而非传统酵母种白利合子酵母菌对醋酸有显著的耐受性。Zbhaa...
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非模式蓝细菌物种注释包构建更新于2021.4.9又写了一个script，用来一次性构建多个物种包的。成功倒是成功了，就是可能效率比较低。主要是用了for循环，然后用列表分别存储各自物种的数据的。可能还...
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R|可视化|morris配色William Morris的方案按照世界名画的配色进行选取，特别适合在sci文章中进行展示。 安装[#%E5%AE%89%E8%A3%85] 所有的颜色都用magick和i...
