时间序列研究的是基因表达的动态行为,测量的是一系列和时间点之间有强烈相关性的过程。和针对某一时间点的基因表达进行差异分析不同,时间序列更加关注是发现基因表达的趋势,以有助于理...
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Cell Ranger是一个“傻瓜”软件,你只需提供原始的fastq文件,它就会返回feature-barcode表达矩阵。为啥不说是gene-cell,举个例子,cell ...
随着高通量单细胞测序行业的纵深发展,一开始在学校做相关学习研究的年轻朋友,或者在业内某公司练过的年轻朋友开始有了找工作的需求。有需求就要被满足。在这篇文章中,结合周老师本人找...
如果你下载了TCGA数据库里的count数据,想把它转换成FPKM应该怎么做呢?参考文章:1.Htseq Count To Fpkm 2.【原创】R语言实战:read cou...
转录组是一类让人既爱又恨的项目,实验门槛低,却是文章泛滥的重灾区,总有人问小编,现在转录组还能发文章吗?下面小编就借一篇2020年5月4日发表在BMC Genomics上题为...
这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】:基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化:总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...
count normalization的方法 这应该会是一个小系列,我会简单介绍下现在的一些count normaliztion的方法,以及对应的代码解释、思考,从而最后得出...
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