猪莎爱学习

开篇先看个风险森林图吧~~ 1.准备输入数据 2.挑选感兴趣的基因构建coxph模型 出自文章Integrated genomic analysis identifies s...

Ruizheng

Ruizheng 的学习笔记 感谢 生信技能树 小洁老师 继续DAY9 的tips 1. 用limma包进行差异分析，要确保 group_list 和 exp 输入没错。 ...

小梦游仙境

老大在群里出的题，说感觉这个热图很诡异，然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量，对于数据不能有正确的认识，导致一开始的deg的logFC都没有达到正负1的，最重要...

井底蛙蛙呱呱呱

在使用Bioconductor 分析芯片数据（一）中我们使用的是芯片的原始数据（即*.cel文件）进行分析，但在大部分情况下我们是可以利用GEO数据库中已有的表达矩阵来进行数...

井底蛙蛙呱呱呱

1、下载安装R相关包 GEOquery 是 NCBI 存储标准化的转录组数据的基因表达综合数据库 GEO 的接口程序。 2、下载芯片数据 教程中我们使用 Dr Andrew ...