这个数据包括了10个单细胞样本，但是他们事先将数据合并了，其实我只需要其中的3个样本，所以我需要拆分一下1.加载数据 2.正式拆分，使用tidyverse函数 3.按照样本将...
发简信
IP属地：广东
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GEO单细胞测序数据样本拆分
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生信小白开始接活——文本处理（二）上篇处理了最简单的单细胞公共数据，即1个样本对应1个矩阵文件（tsv），读取统计就行了，但是GEO公共数据库中还存在如下的情况：例如GSE178318，15个样本的信息全部混...
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肝癌单细胞测序数据集查询1. GSE138709 5个肿瘤样本 + 3个邻近的正常组织 数据集链接：GEO Accession viewer (nih.gov)[https://www.ncbi.n...
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R语言ggstatsplot包做卡方检验-如图所示，卡方值为15.01，p = 0.005 < 检验水准0.05，可认为钻石的颜色与分类不独立，即存在关联。-各个clarity的组内比较，不同颜色钻石的数量的差异均...
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统计方法的选择（3）--非参数检验前面探索了如果对数据进行了数据分布检验，发现符合正态分布，并且数据方法齐性，那么就可以采用参数检验的方法进行统计检验。如果数据的分布不符合正态分布或者方差齐性，那么就要采用非...
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批量处理——apply批量计算组间差异
相比于网页工具，使用编程语言处理科研数据的一大优势，在于高度的定制化，以及批量处理数据的快捷性和高效性 对于批量处理数据的方法，之前使用for循环和apply语句进行处理过，...
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使用R下载HPA数据库的免疫组化数据
HPA数据库有丰富的切片数据和免疫组化的切片，可以从网站一个个下载保存，然后把对应的信息保存，再重命名，再次比对信息。 但是，这样的操作，可谓耗时耗力，还有可能在对比的时候出...
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Stay Hungry. Stay Foolish<br>学点R语言，搞点数据挖掘<br>专注肿瘤研究和学习<br>ORCID:<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Forcid.org%2F0000-0002-0660-7802" target="_blank">https://orcid.org/0000-0002-0660-7802</a><br>CSDN：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Flijianpeng0302%3Ftype%3Dblog" target="_blank">https://blog.csdn.net/lijianpeng0302?type=blog</a> 生信小鹏
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批量处理——for循环批量计算组间差异相比于网页工具，使用编程语言处理科研数据的一大优势，在于高度的定制化，以及批量处理数据的快捷性和高效性 对于批量处理数据的方法，之前使用for循环和apply语句进行处理过，...
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这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
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ggplot2优化小提琴图（添加组间差异显著性，基础知识）这里不直接用ggplot2画，因为要做差异分析，所以直接用ggpubr step0.数据读取 load("Type.Rdata") 首先外面是一个小提琴图，中间一个箱式图，然...
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2019.8月中旬开始系统自学生信，<br>自学路漫漫索性报个班。<br><br>生信技能树真的很棒！<br><br>这是我的一个学习笔记平台，点滴记录。
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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主要分享一些自己的学习过程，以菜鸟干货为主，大家有问题可以在我的博客交流(打赏也是)<br><br>
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<br>自学生信的小白，<br>生物届的一只单身狗!<br><br>从爬虫过来的蛇友！
