Tidymodels: tidy machine learning in R 在处理数据时，有简洁的工具包，tidyverse应运而生，极大地简化数据处理流程，让数据处理变得...
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R机器学习的Tidymodel流水线编程 -
解决Docker以默认root用户运行生成的文件权限为root的问题
只需以宿主机的普通用户运行即可。 docker run --user $(id -u ${USER}):$(id -g ${USER}) -v /etc/passwd:/et...
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收录比较基因组学，进化基因组学，群体基因组学，分子进化，及相关领域的各类文章。特别地。由于是简书，建树的内容当然是必不可少了。 欢迎大家投稿
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分子进化树构建及数据分析方法介绍【转】
首先是方法的选择。基于距离的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolution，最小进化法）和NJ（Neighbor-Joining，邻接法）等。其他的几种方法包括M...
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你可以重写下，当时刚学正则，写的不好
KEGG pathway 注释整理
KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库)，可以获得KEGG ORTHOLOGY(KO...
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Linux和Windows间的远程桌面访问在Windows上面，我们都用过系统自带的远程桌面连接或者TeamViewer这样的工具，可以方便的让我们用图形化方式远程操作其他计算机。但是在Linux上，我们一般都是使用...
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picrust2 预测功能PICRUSt2 PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobs...
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构建非冗余rRNA数据库
构建非冗余rRNA数据库 参考riboPicker官网文档。 下载并安装riboPicker 主要为了使用该软件自带的格式化脚本; 自带的bwa程序版本是0.5.9-r16....
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生物信息分析常用文件格式和软件
生物信息分析常用文件格式和软件 文件格式 数据格式 fastq fasta 注释 gtf gff bed bcf 比对格式 sam bam 工具类 数据质控类 cutadap...
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用cmscan挖掘ncRNA信息（2019-11-4更新）
更新日志：2019年11月4日: 了解了一下预测的结果都是些啥2018年12月27日: 对部分内容进行了修正，添加了新版本Rfam的下载链接。对Z参数的计算进行了修改。201...
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bioconda channel设置如果要使用conda安装生物信息学软件，就需要设置bioconda软件源。下面是官方给出的设置方法： 在国内建议使用中科大的源，设置命令如下， 设置好后，可以查看下conda...
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fasta/fastq序列长度分布统计首先得到每条序列的长度，在这里使用seqkit软件。seqkit软件是一个强大的序列处理工具，安装方法参见官方网站.代码如下： 结果如下所示： 将 Length.txt导入到...
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