clusterProfiler包是Y叔开发的一个强大的能进行多种功能富集的R包,对于有OrgDb或AnnotationHub中收录的物种进行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
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请一定看这里:写下来只是为了记录一些自己的实践,当然如果能对你有所帮助那就更好了,欢迎大家和我交流 差异分析流程: 1 初始数据 2 标准化(normalization):D...
说在前面 在国内做生信的小伙伴或多或少都听过一个大名鼎鼎的名字---Y叔,想当初小编初入生信大门时还专门百度查了一下,他就是南方医科大学生物信息学系主任余光创教授。Y叔在国际...
转载自 LAI: 评估基因组质量一个标准 基因组组装完成之后,就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中,每个contig都能足够的长,能够有一个完整的基...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
论文 Pan-genome inversion index reveals evolutionary insights into the subpopulation stru...
ATACseq 基本原理如下图所示。真核生物 DNA 与核小体结合形成染色质,结合的紧密程度是动态变化的。当 DNA 需要复制或转录时,结合变得松散让 DNA 暴露。暴露的 ...
最近遇到问题,要将annovar的结果转为vcf,然后用这个vcf对比另一个vcf,找二者共有的变异。其实就是一个bedtools intersect的事,但是annovar...