# 官网说明书:https://github.com/millanek/Dsuite ########## 1 Installation # 注意操作系统环境配置:GCC的版...
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昨天看了gatk的官网,从2018年发布正式版的4.0.0开始,到现在已经更新到4.1.8,在速度和准确度上都有了大幅的提升。gatk4除了整合picard软件之外,在使用上...
bwa - Burrows-Wheeler Alignment Tool #1. 介绍 BWA 是一个能将差异较小的测序数据比对到参考基因组的工具。它包含三种算法:BWA-b...
记录下小编自己可能用到的小脚本 (1)fasta转phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq转fast...
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中,可以看出,图片分成2个部分,左边是进化树,右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行测试: 进化树文件: (((A...
conda 直接gatk并不完整,总会有问题,这里提供摸索后的conda安装解决方法 gatkcondaenv2 文件内容
前言:实验中往往比较关注某一信号通路基因的表达变化,而通过文献检索或利用转录组测序结果筛选,往往信息不全,缺乏系统性,如何提取出重点关注的信号通路上所有基因的序列,并进行下游...
效率工具指南:致力成为国内优质的工具测评媒体。 Hello 各位好,我是小豪。 说到哪个流程图工具好用,市面上有太多的选择了,已知的有:draw.io,Visio,Proce...
单倍型分析理论上来说,单倍型的类别是2N,但由于LD的存在,会使得单倍型的类别远远的小于2N,但是如果当N的数目很大,即便是类别少,在整个群体中进行分类也会有很多种单倍型。这...
导读 本文将介绍三种使用VCF文件,构建系统发育树的方法,包括程序的安装,使用,已及系统发育树的可视化与美化。 1. VCF2Dis VCF2Dis[https://gith...