近期在使用exonerate进行蛋白比对基因,对其结果log文件未找到方便提取的脚本,自己写了一个,python脚本(未进行优化,欢迎优化回复!) 使用:python 脚本...
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简介 阿里云盘作为一款网盘,以其不限制下载速度,并且提供了较高的存储空间,为大家所喜欢。虽然目前还是内测期间,但是作为网盘的基本功能已经完善了。目前阿里已经提供了Window...
最近要处理一些基因注释的文件,要用到bedtools这款经典的软件,在慢慢接触到这款软件才发现其功能的强大之处,在接下来的几个星期内将会大家一起入门并且学习掌握使用bedto...
snakemake是一个用来编写任务流程的工具,用python编写的,因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂,易于理解。 一、从一个简单的例子开始 1、安装snakemake 安...
当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham...
写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲的很棒,可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便使用者发现共线性(collin...
此版本为无代码版本,依赖tbtools来实现,纯粹记录自己的学习经验。 蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家族的蛋白序列文件 选择你想要查找的基因家族的基因组蛋白文件 ...
我们知道蛋白一般由一个或多个功能域所组成,在不同蛋白质组合中出现的不同结构域导致了自然界中蛋白质复杂的多样性。鉴定一个蛋白中的结构域有助于更深入地理解蛋白功能。其中Pfa...