现在可以用fasterq-dump, 速度更快，请阅读都8102年了，还用fastq-dump，快换fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打过交道,尤...
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Fastq-dump: 一个神奇的软件 -
三代测序入门移步github 测序原理 共有的特点： 优点：无需前期扩增，不引入偏向性；读长长缺点：错误率高； 10X Genomics：Illumina二代测序的升级版 10X Gen...
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学会正确选择多序列比对（coding-sequences）软件前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析，没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
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mcmctree估算物种分歧时间推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...
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相见恨晚的15个 Linux 神器，你可能一个都没见过
作者 | int32bit 出处｜知乎回答原文 | http://t.cn/R1FKgdN ag：比grep、ack更快的递归搜索文件内容。 tig：字符模式下交互查看git...
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对比了 Python、Go 和 Rust 之后，我们得出了这个结论本文主要是从 Python 开发者的角度基于开发工效学对这三种语言进行的一个比较，你可以跳过讨论部分，直接查看代码示例、性能比较、主要结论或 Python、Go 和 Rust...
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【思考】学习生信是一段孤独的旅程
ps：更新于2019/4/27 境由心造：意识思维的局限而已 这篇文章只是一时的吐槽而已，真实情况是一起的学习的小伙伴病了好久，没人学习交流，一时兴起。本人一直很阳光积极向上...
个人介绍
常居中国南方的 化学生物狗一只，现在溜去CUHK读博去了，从事生物信息的工作。常用语言 python、R、javascript，熟练使用python的工程师一枚。