在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函数...
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Seurat的打分函数AddMouduleScore -
10X单细胞空间联合分析之三----Spotlight在我们之前的分享中，已经分享过很多的单细胞和空间联合分析的方法，有关Spotlight，之前也提到过，但是并没有很认真的对关注这个方法，这次的分享，就让我们来参透这个方法；这...
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10X单细胞空间联合分析方法论hello，又是一周，周二了，最近事情很多，所以祝大家生活快乐，我们来继续看一下10X单细胞空间联合分析的内容，参考文献在Benchmarking spatial and s...
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10X空间转录组的注释流派作者，追风少年i~ 高考第二天，去看了一下在今天高考的数学卷子，惊奇的发现最后的压轴题自己还会做，😄 ，大家不妨试一试，题在下面 以前学数学的时候总是觉得生活中根本用不到，买...
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如何复现一张完美的火山图一篇发表在Nature Communication的肿瘤免疫文章。 数据为本人课题组数据，仅做部分展示（差异基因结果文件）。 group列为自行添加。 下面开始初步绘制火山图...
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Day1—差异分析，我该如何选择？limma DESeq edge ?
目前，转录组学差异分析的三种常用流程：DEseq2、edgeR、limma。 在具体选择哪一个的问题上，有几个点需要明确： 在进行差异分析之前，首先明确你处理的是哪种测序数据...
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转录组分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
