写在前面 荧光定量（qPCR）早已是各个分子生物学实验室常用的简单的实验技术。十年的变化很大。10年前（我大一）到实验室时，常规的pcr都不舍得加多0.2ul的rTaq，更不...
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荧光定量（qPCR）结果整理的辅助小工具 -
WGCNA分析--提升转录组测序文章档次的利器现在做转录组测序，看看差异基因，做做富集分析，再讨论下差异基因功能与自己研究性状或处理之间的关系，最后加简单的qPCR验证，这样的数据发SCI影响因子越来越低了。必须增加新的...
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大数据挖掘，用R语言分析TCGA数据！
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使用HMM进行基因家族鉴定？无人不能。写在前面 很久很久以前，各种原因，我写过一个帖子，《零基础-完全重现某个基因家族分析文章（的分析部分）》 https://www.jianshu.com/p/88075f6c...
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文献解读--通过RNA测序解析玉米籽粒复杂的调控网络1. 文章概述 本篇要解读的文献是一篇发表较早，却比较经典的文章。是2013发表于 Nature Communication 上的一篇 eQTL的文章。 玉米基因组非常复杂，...
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eQTL归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个...
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「nature protocols」组学数据的通路富集分析和可视化: g:Profiler, GSEA, Cytoscape 和 EnrichmentMapnature protocols上发了一篇文章，题目为"Pathway enrichment analysis and visualization of omics data...
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lncRNA研究思路
大家好，首先说明下昨天文章第二段有个错误，应该是“缺氧诱导”，而不是“缺氧敏感”。谢谢小伙伴指出。今天我们要分享的文章是： Zhang A, Zhao JC, Kim J, ...
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用python做生物信息数据分析（1-环境准备）写在前面 四五年前，接触生物信息的时候，阴差阳错，我选择用perl。事实上，直到嫌我，我还是认为我当初的选择，完全正确！。 在做一些小文本的快速处理上，perl在我看来，从来...
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Diamond 比对软件使用Diamond是一个用于比对query蛋白和数据库蛋白（blastp）或query核苷酸序列和数据库蛋白（blastx）的软件，官方测试其性能为blast+的500～2000...
