Step1:链特异性比对并组装转录本 用HISAT2对每个样本进行链特异性比对,随后利用StringTie对每个样本的转录本进行单独组装 Step2:过滤lncRNA 将所有...
IP属地:吉林
Step1:链特异性比对并组装转录本 用HISAT2对每个样本进行链特异性比对,随后利用StringTie对每个样本的转录本进行单独组装 Step2:过滤lncRNA 将所有...
一、ENTREZID转换 进行功能注释,首先需要对差异基因deg数据集进行ENTREZID转换 二、输入数据准备 接下来拿出up基因和down基因的ENTREZID,组成di...
相信很多科研工作者(不包括比我厉害的大佬们)在做转录组时,都是在公司做测序,然后数据也交给公司分析,又然后,期待做个差异分析,得出像下图那么完美的热图。 然而,然而,,我们得...
差异表达分析内容:• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts,RPKM,FPKM,TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ limma-voom,edge...
TaoYan 简介 本文将绘制静态与交互式热图,需要使用到以下R包和函数:heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3heatma...
转载至:https://blog.csdn.net/sinat_30623997/article/details/79250940
仅针对人类而言。虽然一直对GO和KEGG不感冒,但流程化的分析还是要做的。主要包括两部分: 将基因编号转为ENTREZID(具有唯一性):基因编号来自ANNOVAR的注释结果...