目录 前言 bamCompare 工具1.1 工具原理1.2 使用说明1.3 使用实例 bigwigCompare 工具2.1 使用说明2.2 使用实例 前言 今天主要介绍下...
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deeptools工具系列——比较不同bw_bam的信号差异 -
kmer分析的几款软件介绍1.jellyfish 运行jellyfish 2.使用 GCE 进行基因组大小评估 GCE 软件包中主要包含 kmer_freq_hash 和 gce 两支程序。前者用于进...
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基因组比对及T2T kmer可视化软件---RAviz功能介绍老规矩，先和同学们介绍一下为什么要做这么一款软件？基因组比对paf格式文件： 当同学们需要进行基因组层面的序列比较时，通常要面对如上所示的比对结果文件，这个文件可能有几十万甚...
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TBtools | 基因组重测序数据分析常用上游软件「三兄弟」，聚齐了~写在前面 是的，最后，我选择了「一条路走到黑」~ 咱们先不管一些人如何看，东西先整出来。大体如下。 没错。从「原始测序数据」到「SNP Calling」，也就是 从 .fas...
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SCAU Class | 课程作业「基因家族分析」流程参考作业要求 提供一份分析报告，可以以学术论文格式撰写，包含以下部分 选定物种与目标基因家族的原因 家族成员主要特征介绍（基于广泛文献检索) 物种基因组序列与注释信息获取 基于 ...
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ggtree 两个进化树之间连线https://yulab-smu.top/treedata-book/chapter2.html[https://yulab-smu.top/treedata-book/c...
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等位基因特异性表达(ASE)及顺反式调控研究的相关分析整理
在对动植物杂交种（或F1子代）的基因组和转录组的关联研究中，要回答这么一个问题：基因组变异到底与基因表达有什么关系？ 这个问题很难，因为涉及影响基因表达调控的因素可太多了！多...
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用 shapiro.test() 函数进行正态性检验，样本数目过多报错
shapiro.test() 在 R 中有一个限制，它最多只能应用于大小为 5000 的样本，并且最小样本大小必须为 3。 因此，我们有一个替代假设检验，称为 Anderso...
