打开临床数据excel，分别自定义排序futime和fustat,futime中去掉生存天数为0和没有的数据，fustat中去掉无生存状态的数据（1为死亡，0为存活） 将上图...
发简信
IP属地：上海
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TCGA基因表达数据和生存数据合并
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浅谈Linux中的xargs命令在说xargs命令之前，先说两句Linux中的管道（pipe）。 管道负责单向连接前一个程序的标准输出与后一个程序的标准输入，其本质是一个共享文件。我们日常最常用到的管道是匿...
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ls、ls -a、ls -l、ls -al区别ls //显示不隐藏的文件与文件夹 ls -a //显示当前目录下的所有文件及文件夹包括隐藏的.和..等 ls -l //显示不隐藏的文件与文件夹的详细信息...
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生信学习笔记：使用SNP data做基因渗入分析 (3)
距离上次更新这个专题后，该教程的原作者更新了一下原教程，使用了一个新的，非常好用的工具，Dsuite进行基因渗入分析，这期的推文就和大家一起回顾并学习一下该工具的使用，加深对...
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根据vcf文件计算SNP密度并用circlize可视化结果参考 收集vcftools所有用法 命令 100000 是指定窗口长度--out 是输出文件的前缀 使用R语言中的circlize包画图 参考 用circlize包绘制cir...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...
